«Байкальский институт рационального природопользования СО РАН (предшественник БИП СО РАН) создан по инициативе академика В.А. Коптюга Постановлением Президиума Сибирского отделения РАН №95 от 27 марта 1991 г. на базе Байкальского отдела проблем природопользования и отдела социально-экономических исследований Бурятского научного центра СО АН СССР.
При реорганизации академических институтов Сибирского отделения РАН в 1997 г. к Байкальскому институту рационального природопользования СО РАН присоединен отдел химии Бурятского института естественных наук, а сам Институт переименован в Байкальский институт природопользования СО РАН (Постановление Президиума СО РАН № 409 от 6 ноября 1997 г.). Этим же постановлением создан Байкальский объединенный институт природопользования (БОИП) СО РАН в составе Байкальского института природопользования (БИП) СО РАН и Читинского института природных ресурсов (ЧИПР) СО РАН. В 2001 г. он вновь разделен на Байкальский институт природопользования СО РАН и Институт природных ресурсов, экологии и криологии СО РАН (г. Чита).
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 30 декабря 2013 г. № 2591-р БИП СО РАН (под № 339) передан в ведение Федерального агентства научных организаций (ФАНО России, руководитель М.М. Котюков). Непосредственное руководство за деятельностью Института осуществляет Сибирское территориальное управление ФАНО России (Сибирское ТУ ФАНО России, руководитель А.А. Колович).
С 1991 по 2013 гг. Институт возглавлял чл.-кор. РАН, д.г.н. Арнольд Кириллович Тулохонов, специалист в области физической и экономической географии, последователь идей акад. В.А. Коптюга по реализации моделей устойчивого развития на Байкальской природной территории, в 2016 г. избран научным руководителем Института.
С 2013 г. руководство Институтом было возложено на д.г.н. Е.Ж. Гармаева в связи с наделением чл.-кор. РАН А.К. Тулохонова полномочиями члена Совета Федерации Федерального Собрания Российской Федерации. В июле 2015 г. решением общего собрания коллектива Института д.г.н. Ендон Жамьянович Гармаев (специалист в области гидрологии и геоэкологии) был избран на должность директора».
Прохождение практики обучающихся
Организация и проведение практики стдентов по направлениям подготовки 41.03.05 "Международные отношения" и 41.03.01 "Зарубежное регионоведение".