Кафедра «Высшая математика» образована 26 ноября 1962 года.
В разные периоды кафедру возглавляли Матханов М.Н., Павлов П.В., Орехова Р.А., Миронова Э.С., Сордохонова Е.Н..
С 1965 г. по 2009 г. кафедрой руководил доктор физико–математических наук, профессор, член–корр. СО РАН ВШ, заслуженный работник Высшей школы РФ, кавалер ордена «Знак Почета» Шойнжуров Ц.Б., который являлся первым доктором физико–математических наук в области математики в Бурятии.
В 1989г. на кафедре открыта аспирантура по специальности 01.01.07 «Вычислительная математика». Под руководством проф. Шойнжурова Ц.Б. завершили и защитили диссертации на соискание ученой степени кандидата физико–математических наук Корытов И.В., Дашиева С.С., Францев Г.Л., Васильева Е.Г., Цыренжапов Н.Б., Урбаханов А.В., Юмов И.Б., Юмова С.Ж., Санеева Л.И., Булгатова Е.Н.
С 1973 г. регулярно проводятся научные конференции международного масштаба, с участием выдающихся ученых из Германии, Австралии и Бельгии.
Кафедра осуществляет подготовку студентов СФ, ЭТФ, ИЭиП. Обучение ведется по основным разделам Высшей математики.